Gölcük Donanma Komutanlığı İstihbarat Şube Müdürlüğü’nde yapılan aramalarda ele geçirilen belgelerde, eski Deniz Kuvvetleri Komutanı Oramiral Metin Ataç ile şimdiki Deniz Kuvvetleri Komutanı Oramiral Eşref Uğur Yiğitʹe suikast iddiasına yönelik yürütülen “Amirallere Suikast" soruşturmasının devamı niteliğinde notlar bulunduğu iddia edilmişti.
Bu notlara ilişkin soruşturma yürüten özel yetkili İstanbul Cumhuriyet Savcısı Salim Duran, ikinci iddianameyi tamamladı.